Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms