Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms