Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms