Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms