Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDSS1Q5T2R2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms