Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms