Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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C9orf116Q5BN46 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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