Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms