Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms