Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms