Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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