Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC36A3Q495N2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC36A3Q495N2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms