Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms