Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms