Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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