Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTPRNQ16849 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTPRNQ16849 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTPRNQ16849 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTPRNQ16849 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTPRNQ16849 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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PTPRNQ16849 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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PTPRNQ16849 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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PTPRNQ16849 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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