Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HADHQ16836 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HADHQ16836 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HADHQ16836 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HADHQ16836 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HADHQ16836 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HADHQ16836 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HADHQ16836 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HADHQ16836 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HADHQ16836 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HADHQ16836 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms