Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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