Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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