Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CST6Q15828 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CST6Q15828 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CST6Q15828 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CST6Q15828 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CST6Q15828 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CST6Q15828 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CST6Q15828 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CST6Q15828 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CST6Q15828 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CST6Q15828 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CST6Q15828 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CST6Q15828 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CST6Q15828 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CST6Q15828 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CST6Q15828 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CST6Q15828 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CST6Q15828 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CST6Q15828 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CST6Q15828 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CST6Q15828 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CST6Q15828 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CST6Q15828 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CST6Q15828 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CST6Q15828 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CST6Q15828 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CST6Q15828 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CST6Q15828 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CST6Q15828 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CST6Q15828 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CST6Q15828 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CST6Q15828 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CST6Q15828 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms