Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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