Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms