Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
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