Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms