Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms