Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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