Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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