Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
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