Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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