Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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