Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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