Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIGQ13278 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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