Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ERCC8Q13216 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ERCC8Q13216 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ERCC8Q13216 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ERCC8Q13216 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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