Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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