Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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