Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms