Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms