Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms