Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD83Q01151 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD83Q01151 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD83Q01151 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD83Q01151 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD83Q01151 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD83Q01151 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD83Q01151 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD83Q01151 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD83Q01151 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD83Q01151 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD83Q01151 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD83Q01151 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD83Q01151 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD83Q01151 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD83Q01151 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD83Q01151 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms