Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms