Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms