Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPS29P62273 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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