Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCDC1P59894 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCDC1P59894 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms