Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB25P57735 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB25P57735 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB25P57735 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms