Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms