Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms