Protein–RNA interactions for Protein: P51610

HCFC1, Host cell factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1P51610 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCFC1P51610 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms