Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RORCP51449 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RORCP51449 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RORCP51449 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RORCP51449 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RORCP51449 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RORCP51449 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RORCP51449 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RORCP51449 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RORCP51449 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RORCP51449 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RORCP51449 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RORCP51449 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms