Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms