Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms